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上海科学普及出版社以普及科学技术知识、倡导科学方法、传播科学思想、弘扬科学精神、提高全民科学素养为己任，出版了许多科普精品图书。
出版的重点科普图书有引进版图书《科学大师》，有介绍著名的科学家郭申元博士的《想象拥抱的世界——郭申元博士的故事》，该书被选入中宣部和新闻出版总署向全国青少年推荐的“百种青少年优秀图书”。 “21世纪中国原创科普佳作系列”图书如《图解现代生态学入门》、《写给小“叶永烈”》、《科学精神启示录》、《生物“芯”时代》、《宇宙文明探索》。围绕贯彻落实《全民科学素质行动计划纲要》，出版了《〈全民科学素质行动计划纲要〉解读》。《海上大师》以中国现代科学奠基者在上海的活动为线索，展示了众多自然科学和社会科学大师为开创中国现代化科学、传播科学文化所做的贡献。“学科故事丛书”第二辑包括《揭开生命奥秘》、《探索昆虫“语言”》、《话说中国帆船》和《走进深海大洋》等。
系列科普图书“科学眼丛书”于2009年陆续出版，有《基因与健康》、《从泰勒斯到达尔文》、《大脑与基因》等。
初级和中级实用计算机类图书是本社的出版强项，“中老年人学电脑”、“中老年人学上网”、“中老年人学数码”系列，“五笔字型速成”系列，“电脑基础标准培训教程”系列，“中文版教程”系列，“《中国电脑教育报》电脑万事通”系列等，具有易学、易操作、易掌握的特点，不同年龄层次的读者均能找到其所需的电脑学习书籍。如针对网上开店进行创业的“e时代百万富翁系列”丛书，向读者全方位展示网上开店的基本流程。
生活实用类图书贴近读者的生活实际，颇有亮点。如烹饪类图书、毛衣编织类图书等，“果蔬雕刻”系列，“情调生活”系列，《燕翅鲍肚参》、《新编大众菜谱》、《天天家常菜谱》等图书常年畅销，自“快乐生活1001”系列取得良好的市场业绩后，新近推出的“图说生活”系列数十种受到读者的欢迎，该系列又分为“美食天下”、“健康指南”、“美丽女人”、“生活365”等子系列，《求医不如求食》、《黄帝内经养生智慧》、《家常滋补养生汤粥》、《四季养生食谱》、《专家推荐的女性营养保健食谱》等自上市起便热销，深受读者青睐。
其宗旨是“弘扬科学精神，普及科学知识，传播科学思想和科学方法，展示科技发展成就，为提高公众的科学文化素质，促进科学技术进步，推动社会主义物质文明和精神文明服务”。
弘扬科学精神，普及科学知识，传播科学思想和科学方法，为广大科技工作者服务。向各行业、不同文化程度的广大读者普及科学知识和先进技术，为提高全民族的科学文化素质、造就科技人才服务是科普出版社的办社宗旨。科普出版社（暨中国科学技术出版社）成立45年来，已出版各类科普和科技图书3万多种，总发行量达6亿册以上，平均年出版新书500种。2000年科学普及出版社码洋首次突破一个亿。经过多年的努力，科普出版社以出版科普、科幻、宣传马克思主义唯物论、无神论，宣传“四科”精神及高水平的学术专著等基础性、战略性、前瞻性、实效性和创新性的图书著称。
近期推出的精品书如：宣传“四科”精神的《院士心迹》、《厚望与期待》、《回顾与展望》、《世纪辉煌》；宣传马克思主义唯物论、无神论的《崇尚科学破除迷信》等挂图及出版物；宣传21世纪科学教育的《面向全体美国人的科学》、《科学教育的改革蓝本》、《科学素养的基准》、《阅读的革命》等科学教育的经典读物；宣传普及科学知识的《中国科普文选》、《轻松电脑丛书》、《新世纪科普知识读本》等有一定影响的书。被新闻媒体称为科普出版的“皇家”出版社。
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