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在嘌呤核苷酸中，嘌呤碱以第9位的N与戊糖第1'位的C以核苷键相连接；戊糖第5'位的C再与磷酸以脂键相结合；
而嘧啶核苷酸中，则是嘧啶碱以第1位的N与戊糖第1'位的C以核苷键相连接，其它不变。
嘌呤合成从5-磷酸核糖焦磷酸开始，先经一系列酶促反应，生成次黄嘌呤核苷酸，再转变为其他嘌呤核苷酸；（即在磷酸核糖基础上成环）
嘧啶合成则是先合成嘧啶环，再与PRPP合成乳清苷酸，脱羧形成尿嘧啶核苷酸，再以此合成其他嘧啶核苷酸。（先成环，再接到磷酸核糖上）这是最主要的区别。
此外嘌呤是形成咪唑环后还要合成第二个环，而嘧啶只有一个嘧啶环。
扩展资料：
嘧啶核苷酸的补救途径，可通过磷酸核糖转移酶催化，使各种嘧啶碱接受PRPP供给的磷酸核糖基直接生成嘧啶核苷酸；也可在核苷磷酸化酶催化下，嘧啶碱先与核糖-1-磷酸反应生成嘧啶核苷，再在嘧啶核苷激酶催化下，被磷酸化生成核苷酸。
嘧啶核苷酸的从头合成与嘌呤核苷酸不同，嘧啶环的元素来源于谷氨酰胺、二氧化碳和天冬氨酸，其特点是首先将这些原料合成嘧啶环，然后与PRPP反应生成。
百度百科-嘧啶核苷酸的生物合成
人体内的嘌呤碱基主要是人体自行合成，食物来源地嘌呤只占极小的比例。在人体内的嘌呤的合成有两种途径，即从头合成途径和不就合成途径。从头合成途径是主要途径，嘌呤核苷酸的从头合成途径是嘌呤核苷酸的主要合成途径，是指机体利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位和二氧化碳等简单物质，经过一系列极其复杂的酶促反应，合成嘌呤核苷酸。在这种合成途径中，嘌呤碱基的合成一开始就沿着合成嘌呤核苷酸的途径进行，即在磷酸核糖的分子上逐步合成嘌呤核苷酸，而不是首先单独合成嘌呤碱基，然后再与磷酸核糖结合的，这是嘌呤核苷酸从头合成途径的重要特点。
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